需要注意，这里说的是在“全部有效文件”被收到后60日以内，所以如果发起人提交的文件不全，或者有的必备文件不符合要求（例如筹备申请书填写不完全），或者有的文件不是有效文件，比如业务主管单位的批准文件无效（例如，仅有单位领导签字但是没有加盖公章，或者盖的是主管单位的某个职能部门的章而非单位公章），则登记管理机关有权要求补齐有关文件，并且在补齐之后的60天内作出决定。如果提交的文件不全，登记管理机关也应当有权直接决定不批准。对此，
《条例》第
13条虽然没有明确将其作为不批准的理由之一，但是从第
11条、第
9条的规定显然可以推知这个结论。
登记管理机关在审查批准筹备过程中的审查，是设立程序中最关键的一步。“审查分为形式审查和实质审查。形式审查的主要任务是从表面上查验社团所提交的材料是否齐全，有无疏漏，以及材料内容有无明显错误等。实质审查是登记程序中至关重要的环节，它的主要任务是从宏观上考察社团是否符合社会主义物质文明和精神文明建设的需要，是否在某一学科和领域内具有权威性和广泛的代表性，从而判断该社团是否有成立的必要。审查的具体内容包括社团的名称是否同其业务范围、成员分布、活动地域相一致，社团的日常办事机构场所是否落实，以及有无必要的活动经费和正当的经费来源等，在完成这一审查后，还要作进一步的实际调查，以核实情况，验证社团送提供的材料的真实性。”
《条例》第
13条规定了登记管理机关决定不予批准的几个主要理由。
1、有根据证明申请筹备的社会团体的宗旨、业务范围不符合条例第4条规定。
《条例》第
4条规定：“社会团体必须遵守
宪法、法律、法规和国家政策，不得反对
宪法确定的基本原则，不得危害国家的统一、安全和民族的团结，不得损害国家利益、社会公共利益以及其他组织和公民的合法权益，不得违背社会道德风尚。社会团体不得从事营利性经营活动。”从这一条本身来看，是要求已经合法成立的社会团体的活动应当符合这些要求。但是第13条又确定，如果申请筹备的社会团体如果将来会违反这些规定而进行活动，则不予批准成立，应当认为这符合第4条规定的目的以及公共利益的维持。
分析这种不批准筹备的理由，有下面几点是需要特别予以研究的。
（1）“社会团体必须遵守
宪法、法律、法规和国家政策”。社会团体如同所有的公民和组织一样，其活动应当符合
宪法、法律、法规，这在法治社会中不言而喻的。不过，这里还规定社会团体必须遵守“国家政策”，什么是社会团体应当遵守的“国家政策”，目前学术界还缺乏研究。从实务上看，各个国家机关常常把自己向下级机关下发的各种文件称为“政策”，这些“政策”并没有制度化的公布方法，其中有的会因为各种偶然的原因而公布（主要是发布机关有选择地进行的汇编），也有的文件是不公布的。让社会团体遵守这些“政策”，包括不公布的“政策”，从法治原则看是有问题的。
