（二）生态补偿对象应尽力实现直接补贴
　　
　　生态补偿的最终受益者肯定是生态系统，但生态系统的最终受益，必须经过中间受益人才能实现。即生态补偿的补贴，只有体现到生态系统所在地的居民，最终通过他们对生态环境影响行为的变化，才能体现到生态系统。此外，在我国民族地区生态补偿中还有一个“因环境保护和建设而致财政收入减少的地方政府”，也是生态补偿的重要对象。
　　
　　西部地区在退耕还林还草的立法中，对退耕农户改间接补偿为直接补贴，大大减少了中间环节，减少了腐败，提高了整体效率，这是值得借鉴的。民族地区的生态补偿，在补偿对象明确的情况下，应尽量采用直接补偿的形式，可以具体到一个县、乡或更小的村社和个人。
　　
　　（三）生态补偿标准，既要考虑受偿地区的生态贡献，又要顾及补偿者的承受能力
　　
　　如果按照环境经济学测算出来的“生态价值”，那将是一个天文数字！而对“外部性溢出”的数量化研究，目前仅仅停留在理论层面，要形成实际操作还面临一系列困难。当前，有些研究机械照搬国外标准，评估指标选取的任意性、计算方法的无序性和重复计算问题，非市场价值评估的不确定性，理论计算与实际应用相脱节，等等，都需要认真解决。并要通过加大科学研究的力度，特别是生态功能基础研究的力度逐步解决若干亟待解决的理论、方法等问题。
　　
　　（四）生态补偿机制的实现形式应具有多元化特征
　　
　　国内外曾创造了名目繁多的生态补偿形式，归纳起来大致有如下五类，即：资金补偿、实物补偿、项目补偿、政策补偿、智力补偿。前两种可以看作是输血型的补偿形式，后三种是造血型的补偿形式。从现实情况看，输血型的补偿形式自然是很直接、很实惠的选择。但从长远看，生态补偿的长效机制应该更加重视造血型的补偿形式，因为这可以使受偿者充分发挥其发展经济的潜能，所开成的造血机能，最终能转化为自我积累和自我发展的能力。
　　
　　（五）生态补偿长效机制的法制化问题
　　
　　生态补偿机制的建立、生态补偿行为的实施等，都需要通过法律法规的刚性约束来实现。同时，生态补偿法制化也是生态补偿本质的内在要求。因为生态补偿的本质，实际上是在生态保护的实施者和受益者之间重新分配利益的问题。根据博奕理论分析，对于实施生态保护并且使受益方对实施方进行补偿，要想使帕累托改进成为纳什均衡（Nash Equilibrium），需要无穷次地重复博奕内容，并引入冷酷策略（Grim Strategies）就可以达到。这表明，只有建立起长效运行机制，才能保证生态补偿的代内公平、代际公平和自然公平。而建立长效机制的根本保证就是法律保证。

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